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Qu’est-ce qu’un virus ?
- / SANTÉ
25 juillet 2022
QU’EST- CE QU’UN VIRUS ?
Un virus est le plus petit type de parasite existant et sa taille est généralement comprise entre 0,02 et 0,3 micromètre (μm). Cependant, certains virus peuvent atteindre 1 μm.
LE CONTENU D’UN VIRUS
Les virus sont constitués de courtes séquences d’acide nucléique, qui peuvent se présenter sous la forme d’acide ribonucléique (ARN) ou d’acide désoxyribonucléique (ADN) comme matériel génétique. Par rapport à la plupart des autres organismes où l’ADN est toujours une structure à double brin, les virus sont uniques car leur matériel ADN ou ARN peut être soit simple soit double brin.
La structure typique d’un virion, terme utilisé pour décrire un virus unique, comprend une enveloppe extérieure, appelée capside ou membrane protéique. La fonction première de cette enveloppe extérieure est de protéger l’information génétique du virion contre les dommages physiques, chimiques ou enzymatiques.
CLASSIFICATION DES VIRUS HUMAINS
Un virus est souvent classé en fonction de ses propriétés physicochimiques, de la structure de son génome, de sa taille, de sa morphologie et de ses processus moléculaires. En ce qui concerne leur matériel génétique, les virus sont classés selon qu’ils sont des virus à ARN ou à ADN et selon le brin de leur matériel génétique, qui peut être double brin (ds), simple brin (ss) ou partiellement ds. En outre, les virus ss seront également classés selon qu’ils sont ss positifs, ss négatifs ou négatifs avec des virus ambisense.
À ce jour, cinq familles de virus humains à ADNdb ont été identifiées, dont les adénoviridés, les herpèsviridés, les papillomaviridés, les parvoviridés et les poxiviridés. Picobirnaviridae, picornaviridae et reoviridae sont les trois virus humains à ARNdb qui ont été identifiés.
Par rapport aux virus à ADN, les virus à ARN qui ont infecté l’homme sont beaucoup plus nombreux. Parmi eux, on compte neuf familles de virus à ARNs négatifs et huit familles de virus à ARNs positifs.
La morphologie de la capside, notamment les formes icosaédriques, hélicoïdales ou complexes, peut également être utilisée pour classer un virus donné. La présence ou l’absence d’une enveloppe sur le virus est également intégrée dans sa classification.
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COMMENT LES VIRUS NOUS INFECTENT-ILS ?
La surface extérieure du virus est cruciale pour sa capacité à reconnaître et à se fixer aux cellules hôtes. En général, la surface du virus contient certaines protéines capables de reconnaître et de se lier à des récepteurs cellulaires pour faciliter sa fixation à la cellule hôte.
Une fois que le virus s’est fixé à la cellule hôte, il est englouti par la membrane cellulaire et pénètre ensuite dans le cytoplasme de la cellule. À l’intérieur de la cellule, le virus va retirer son enveloppe virale dans des vésicules cellulaires plus petites, libérant ainsi son matériel génétique dans le cytoplasme pour sa réplication.
Les virus ne disposent pas des mécanismes nécessaires pour survivre de manière indépendante et chercher des cellules hôtes végétales, animales ou bactériennes où ils peuvent utiliser les mécanismes de ces cellules pour se répliquer. Par conséquent, les virus utiliseront l’une des différentes voies de transmission pour infecter les cellules hôtes, parmi lesquelles la transmission par contact direct, la transmission indirecte, la transmission par véhicule commun et la transmission par voie aérienne.
Transmission par contact direct
La voie de transmission par contact direct nécessite un contact physique entre un sujet infecté et un sujet non infecté, par exemple par un baiser, une morsure ou un rapport sexuel. Parmi les virus sexuellement transmissibles les plus connus figurent le virus de l’immunodéficience humaine de type 1 (VIH-1), le virus T-lymphotrope humain de type 1 (HTLV-1), le virus de l’hépatite B (VHB) et les papillomavirus humains de types 16 et 18 (respectivement HPV-16 et HPV18).
Transmission indirecte
L’impact de l’amplification génique dans l’adaptation des virus par le biais d’hôtes intermédiaires.
Des chercheurs rapportent la détection d’un virus de l’influenza A porcin avec des segments de gènes d’origine aviaire H9N2. Le virus d’Epstein-Barr peut se réactiver dans un long COVID. Par transmission indirecte, le virus est transmis par contact avec des objets ou des matériaux contaminés, tels que du matériel médical ou des ustensiles de cuisine partagés.
Transmission par véhicule commun
On parle de transmission par véhicule commun lorsqu’une personne est exposée au virus à partir d’une source contaminée comme de la nourriture, de l’eau, des médicaments ou des liquides intraveineux. Alors que le cytomégalovirus est un virus associé à l’urine, plusieurs virus se transmettent par voie fécale-orale, dont les poliovirus, les coxsackievirus, le virus de l’hépatite A, les rotavirus, les astrovirus et les norovirus.
Transmission par voie aérienne
La transmission par voie aérienne fait référence à la voie d’exposition respiratoire pour les virus qui peuvent se présenter sous forme de gouttelettes, d’aérosols et de sécrétions respiratoires sur les mains et les objets. Parmi les principaux virus transmis par cette voie figurent le virus de la grippe, le virus varicelle-zona, le rhinovirus humain, l’adénovirus humain, le virus respiratoire syncytial, le virus parainfluenza, le métapneumovirus et les coronavirus.
CORONAVIRUS
Au sein de la famille des coronaviridae, on trouve plusieurs coronavirus qui peuvent provoquer des maladies respiratoires et digestives chez les vertébrés. Le coronavirus le plus récent à avoir modifié la société et la santé humaine dans le monde est le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2), qui est le virus responsable de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Le terme coronavirus est basé sur les protéines de pointe en forme de couronne qui s’enroulent autour de la surface de ces virus. À l’intérieur de ces protéines en pointe se trouve le domaine de liaison au récepteur (RBD), qui joue un rôle crucial dans l’entrée des coronavirus dans les cellules hôtes. Par exemple, les RBD du SARS-CoV et du SARS-CoV-2 se lient tous deux au récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) présent à la surface des cellules hôtes pour y pénétrer.
Les coronavirus, qui sont des virus à ARNs positifs enveloppés, peuvent être classés en quatre genres : alpha, bêta, delta et gamma-coronavirus. Alors que les chauves-souris sont souvent le réservoir de la majorité des alpha- et bêta-coronavirus, y compris le SRAS-CoV-2, les oiseaux sauvages sont plus susceptibles d’être les réservoirs des gamma- et deltacoronavirus.
Les coronavirus peuvent être subdivisés en espèces distinctes en raison de leur capacité d’évolution rapide. À cette fin, les coronavirus présentent des taux de mutation élevés et une recombinaison homologue de l’ARN, deux facteurs qui contribuent à la grande diversité de ces virus et à l’émergence récurrente de nouveaux variants.
Certains alphacoronavirus comme le NL63 et le 229E, ainsi que des bêta-coronavirus comme le OC43 et le HKU1, provoquent chez l’homme des symptômes bénins associés au rhume. En revanche, l’infection par le SRAS-CoV-2 peut provoquer des symptômes extrêmement graves qui entraînent le syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA) et la mort. En fait, au 11 février 2022, le SRAS-CoV-2 avait infecté plus de 407 millions de personnes dans le monde et causé plus de 5,8 millions de décès.
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